Украинские ученые из Института молекулярной биологии и генетики провели масштабное исследование микроорганизмов киевского метрополитена и выяснили, какие вирусы и бактерии там живут.
Об этом ученые сообщили на странице Института в Facebook.
Анализ столичного метро провели в рамках крупнейшего в мире метагеномного исследования городских микроорганизмов, обитающих и в воздухе, и на поверхностях, к которым прикасаются люди.
Ученые из разных стран изучили данные с 60 городов мира.
В 97% образцах из всех локаций исследователи обнаружили общий основной набор 31 вида микроорганизмов.
Они выяснили, что всего в метро в разных городах живет 4246 известных видов микроорганизмов, но и одновременно с ними — 10928 новых вирусов и 748 бактерий.
В киевском метро ученые обнаружили типичного представителя кожной микрофлоры человека — сutibacterium acnes.
«Он обычно наблюдается у здоровых людей. Эта бактерия входит в состав основных 31 видов, найденных во всех 60 городах, что еще раз свидетельствует об огромном влиянии человека на городскую среду«, — рассказывает младшая научная сотрудница ИМБГ Алина Фролова из группы системной биологии.
Однако ученые обнаружили и виды, которые уникально характеризуют киевское метро, например, Mycobacterium sp. VKM Ac-1817D — бактерию, которую впервые идентифицировали в 2015 году.
Это непатогенная микобактерия, которая, по словам ученых, помогает синтезировать фармацевтические стероиды.
«Это не означает, что эта бактерия присутствует в больших количествах, или мы сразу можем ее использовать с биофармацевтической целью, однако поиск и обнаружение новых бактерий с похожими свойствами обладает огромным потенциалом«, — рассказывает Фролова.
Благодаря исследованию ученые сформировали первый в мире систематизированный каталог городской экосистемы микроорганизмов.
«Каждый город имеет свой собственный молекулярный отпечаток, который его определяет. Если бы вы дали мне свою обувь, я мог бы примерно с 90% точностью сказать, с какого вы города«, — говорит председатель консорциума Кристофер Мэйсон, профессор медицины в Weill Cornell (WCM), Нью-Йорк.
Проект содержит аннотацию всех идентифицированных микроорганизмов, а также тысячи вирусов и бактерий и двух архей, которых не найдено ни в каких базах данных.
«Люди часто считают, что тропический лес — это щедрость биоразнообразия и новые молекулы, которые можно применить для лечения тех или иных болезней, впрочем, это также касается перил или скамеек метро«, — уверяют ученые.
Проект начался в 2013 году, когда Кристофер Мэйсон начал сбор и анализ образцов микробов в метрополитене Нью-Йорка.
В 2015 году по инициативе ученого был создан Международный консорциум MetaSUB (сокращение от Metagenomics and Metadesign of Subways and Urban Biomes), который охватил не только изучение микробиомов на твердых поверхностях, но и в образцах городского воздуха, воды и сточных вод.
Киев присоединился к проекту в 2017 году.
Каждый год 21 июня MetaSUB проводит глобальный сбор образцов по всему миру. Их собирают с помощью стерильных тампонов, не содержащих никаких ДНК и РНК, и отправляют в лабораторию.
Смотрите также:
Читайте далее: грязные деньги — какие бактерии живут на поверхности купюр.
